Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2012B1B0R1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms