Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik3B1AS29 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms