Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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