Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms