Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms