Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ckap5A2AGT5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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