Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc163A2AGD7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms