Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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Prdm16A2A935 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm16A2A935 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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