Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Speer3W4VSP1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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