Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm4T1NXB5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms