Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcniQ9Z2V9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms