Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ubl3Q9Z2M6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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