Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms