Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ilf3Q9Z1X4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ilf3Q9Z1X4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ilf3Q9Z1X4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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