Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn3Q9Z0G9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cldn3Q9Z0G9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn3Q9Z0G9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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