Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PapolbQ9WVP6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PapolbQ9WVP6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms