Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nme3Q9WV85 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms