Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp1a4Q9WV27 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms