Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabbr1Q9WV18 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms