Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam50aQ9WV03 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam50aQ9WV03 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms