Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vax2Q9WTP9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms