Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psma4Q9R1P0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms