Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nek3Q9R0A5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nek3Q9R0A5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nek3Q9R0A5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Nek3Q9R0A5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Nek3Q9R0A5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek3Q9R0A5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms