Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Col4a3Q9QZS0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Col4a3Q9QZS0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Col4a3Q9QZS0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col4a3Q9QZS0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col4a3Q9QZS0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Col4a3Q9QZS0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a3Q9QZS0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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