Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms