Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phtf1Q9QZ09 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phtf1Q9QZ09 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms