Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Rdh11Q9QYF1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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