Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms