Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Crim1Q9JLL0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Crim1Q9JLL0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Crim1Q9JLL0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms