Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Col5a3Q9JLI2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col5a3Q9JLI2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col5a3Q9JLI2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Col5a3Q9JLI2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Col5a3Q9JLI2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Col5a3Q9JLI2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Col5a3Q9JLI2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col5a3Q9JLI2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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