Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Tmod4Q9JLH8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod4Q9JLH8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Tmod4Q9JLH8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod4Q9JLH8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Tmod4Q9JLH8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmod4Q9JLH8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms