Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr5Q9JLF7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms