Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nectin3Q9JLB9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nectin3Q9JLB9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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