Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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