Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms