Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gfra4Q9JJT2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfra4Q9JJT2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms