Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms