Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tmod3Q9JHJ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tmod3Q9JHJ0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tmod3Q9JHJ0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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