Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp29Q9ES63 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp29Q9ES63 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp29Q9ES63 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp29Q9ES63 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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