Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Barx1Q9ER42 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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