Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clstn1Q9EPL2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clstn1Q9EPL2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms