Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubiad1Q9DC60 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubiad1Q9DC60 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms