Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hmg20aQ9DC33 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hmg20aQ9DC33 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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