Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms