Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Swt1Q9DBQ9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms