Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms