Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Chmp2aQ9DB34 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Chmp2aQ9DB34 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Chmp2aQ9DB34 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Chmp2aQ9DB34 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp2aQ9DB34 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Chmp2aQ9DB34 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Chmp2aQ9DB34 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Chmp2aQ9DB34 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Chmp2aQ9DB34 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Chmp2aQ9DB34 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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