Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smco2Q9DA21 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms