Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms