Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Alkbh4Q9D8F1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Alkbh4Q9D8F1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Alkbh4Q9D8F1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Alkbh4Q9D8F1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Alkbh4Q9D8F1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Alkbh4Q9D8F1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms